RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SMCO3A2RU48 225 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PROB1E7EW31 1015 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TCAPO15273 167 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PIAS2O75928 621 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 GCGP01275 180 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PNLIPP16233 465 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 FUT3P21217 361 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 GABREP78334 506 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 HHEXQ03014 270 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 DTX1Q86Y01 620 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 LURAP1Q96LR2 239 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 AGMATQ9BSE5 352 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 DHRS3O75911 302 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 NUDT14O95848 222 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OPN1MWP04001 364 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SRPXP78539 464 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 H3F3AP84243 136 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TLE3Q04726 772 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 NOGQ13253 232 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR8B8Q15620 311 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 DDIT4LQ96D03 193 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.6□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CDC14CA4D256 554 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CLDN34H7C241 214 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 COX5BP10606 129 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 EPHA1P21709 976 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CAPZBP47756 277 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SP6Q3SY56 376 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SLC35G3Q8N808 338 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 GPER1Q99527 375 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 P2RX4Q99571 388 aa8.59□□□□□ -1.03
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HCG18-242ENST00000602319 OR1D4P47884 311 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 MTCP1P56278 107 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR8G1Q15617 311 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZSR6 202 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR1P1Q8NH06 330 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR4X1Q8NH49 305 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 DDA1Q9BW61 102 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 GPR87Q9BY21 358 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.59□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PGA5P0DJD9 388 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CD200P41217 278 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TLE4Q04727 773 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GNMTQ14749 295 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TAF9Q16594 264 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZPA2 131 aa8.59□□□□□ -1.04
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 R3HDM4Q96D70 268 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ADGRG7Q96K78 797 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TP53RKQ96S44 253 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.59□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 EREGO14944 169 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 EFNA2O43921 213 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 TNFRSF9Q07011 255 aa8.58□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.58□□□□□ -1.04
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