RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598444.1

ARHGEF1-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARHGEF1, Length 425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-215ENST00000598444 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 DTX3Q8N9I9 347 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 MALSU1Q96EH3 234 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 RNFT2Q96EX2 444 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF714Q96N38 554 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CHST6Q9GZX3 395 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 GLS2Q9UI32 602 aa7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 hADV38S2A0JD32 116 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 VGLL3A8MV65 326 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ODF3BA8MYP8 253 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 J3QRE1 110 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 EI24O14681 340 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLC16A6O15403 523 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ISG15P05161 165 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OCM2P0CE71 109 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PRKACAP17612 351 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ACTA2P62736 377 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ACTG2P63267 376 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ACTC1P68032 377 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ACTA1P68133 377 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF91Q05481 1191 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF146Q15072 292 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF626Q68DY1 528 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 FDX2Q6P4F2 183 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 UTS2BQ765I0 119 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TMEM219Q86XT9 240 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 C1QL4Q86Z23 238 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 RFT1Q96AA3 541 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 AASSQ9UDR5 926 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 HHLA2Q9UM44 414 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.16□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 MEGF11A6BM72 1044 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 A6NDX4 124 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SNTNA6NMZ2 147 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SIRPB1O00241 398 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SH2D1BO14796 132 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 MGST3O14880 152 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PSPNO60542 156 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ALDH3A2P51648 485 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CCR9P51686 369 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SCN1BQ07699 218 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TCF23Q7RTU1 214 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 NDNFQ8TB73 568 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CFHR4Q92496 578 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SPSB1Q96BD6 273 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 LGALS12Q96DT0 336 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PELI1Q96FA3 418 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OPALINQ96PE5 141 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SPACA5Q96QH8 159 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 MBOAT4Q96T53 435 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 HMG20AQ9NP66 347 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TCF19Q9Y242 345 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.15□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms