RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-210	ENST00000580357	PRKACA	P17612	351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	BCL3	P20749	454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	CRHBP	P24387	322 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	BDKRB2	P30411	391 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	NPBWR2	P48146	333 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	COL10A1	Q03692	680 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	FGFRL1	Q8N441	504 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	RFT1	Q96AA3	541 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	CNBD2	Q96M20	576 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SPACA5	Q96QH8	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SLC6A7	Q99884	636 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357		F8VVB4	439 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357		F8VWA3	439 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	HAND1	O96004	215 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	TGFBR2	P37173	567 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	MTNR1B	P49286	362 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ZP1	P60852	638 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	IRF3	Q14653	427 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ELP2	Q6IA86	826 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	VENTX	O95231	258 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	SFTPB	P07988	381 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	FST	P19883	344 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	PRTN3	P24158	256 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	LMO1	P25800	156 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	PTGFR	P43088	359 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	DOC2B	Q14184	412 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	MED22	Q15528	200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	CHST4	Q8NCG5	386 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	LHX4	Q969G2	390 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	S100A13	Q99584	98 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	MGST3	O14880	152 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF737	O75373	536 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	GPR176	Q14439	515 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	RSU1	Q15404	277 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	TRAM1	Q15629	374 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357		Q8NFD4	153 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IFT20-210	ENST00000580357	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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