RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF714Q96N38 554 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RCHY1Q96PM5 261 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR8B4Q96RC9 309 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 INTS14Q96SY0 518 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 AMELYQ99218 206 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 P2RX4Q99571 388 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SAR1AQ9NR31 198 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZFP57Q9NU63 452 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 K7N7A8 449 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 M0QZK8 103 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR2F2O95006 317 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SCGB1D1O95968 90 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CCR9P51686 369 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 PMS2P11Q13670 270 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 BATF2Q8N1L9 274 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 V9GYQ6 96 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 hADV38S2A0JD32 116 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 J3QT63 122 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GSC2O15499 205 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GMNNO75496 209 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 HTR3BO95264 441 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 IFNGP01579 166 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 AMY1AP04745 511 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 AMY2AP04746 511 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RANBP1P43487 201 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR3A4PP47883 348 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 VBP1P61758 197 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 VAMP2P63027 116 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SNAPC1Q16533 368 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GLYATQ6IB77 296 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 COMMD2Q86X83 199 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF573Q86YE8 665 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 THEM6Q8WUY1 208 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 DUX3Q96PT4 197 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CDRT15Q96T59 188 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 NIPAL2Q9H841 368 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 DPM3Q9P2X0 92 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 LYSTQ99698 3801 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 XKRY2A2RUG3 117 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CCL24O00175 119 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 NRASP01111 189 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LYNP07948 512 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RRM2P31350 389 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HTR2BP41595 481 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35B1P78383 322 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 EDDM3AQ14507 147 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF124Q15973 351 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 IGSF11Q5DX21 431 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF695Q8IW36 515 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OTULINQ96BN8 352 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PYURFQ96I23 114 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HES4Q9HCC6 221 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.21□□□□□ -1.26
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