RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556262.5

SDR39U1-218, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SDR39U1, Length 1,960 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1-218ENST00000556262 TMEM82A0PJX8 343 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 DISC1C4P0D8 188 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 F8VVB4 439 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 F8VWA3 439 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 M0R1B8 84 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PDCD1Q15116 288 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ELMOD3Q96FG2 381 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 IFT46Q9NQC8 304 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ST3GAL6Q9Y274 331 aa15.95■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 CSN2P05814 226 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 TBPP20226 339 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 BCL3P20749 454 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 GMFBP60983 142 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 NAAAQ02083 359 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ARFRP1Q13795 201 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PPA1Q15181 289 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 SUN5Q8TC36 379 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ST8SIA4Q92187 359 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MUCL1Q96DR8 90 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PRRT1Q99946 306 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PIGMQ9H3S5 423 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.94■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 SYNGR1O43759 233 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 AMY2AP04746 511 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 CCKARP32238 428 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 C4orf46Q504U0 113 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 TOR2AQ5JU69 321 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 BRICD5Q6PL45 260 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PRORYQ9H606 182 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 KIF25Q9UIL4 384 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF735P0CB33 412 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 CXCL2P19875 107 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 FABP6P51161 128 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 GNG3P63215 75 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 LY6DQ14210 128 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 LPCAT3Q6P1A2 487 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 FBXW5Q969U6 566 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 GSX2Q9BZM3 304 aa15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 OR5B21A6NL26 309 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 C3orf80F5H4A9 247 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 GOSR2O14653 212 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 M6PRP20645 277 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 NKPD1Q17RQ9 610 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF488Q96MN9 340 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 BCL2L14Q9BZR8 327 aa15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 H0YL77 283 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 OR4E1P0C645 316 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 S100A11P31949 105 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 HRH1P35367 487 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 RBM11P57052 281 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 H2BFSP57053 126 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 WDR86Q86TI4 376 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZDHHC22Q8N966 263 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 SLC6A7Q99884 636 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF573Q86YE8 665 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 OR51I2Q9H344 312 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.91■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 PLCE1Q9P212 2302 aa15.9■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 SERPINE3A8MV23 424 aa15.9■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 RP2O75695 350 aa15.9■□□□□ 0.14
SDR39U1-218ENST00000556262 RHBDL1O75783 438 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms