RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 F5H0A9 414 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 J3QT63 122 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 CCRL2O00421 344 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 RHBDL1O75783 438 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SFTPBP07988 381 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 RBP2P50120 134 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ATP1B3P54709 279 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 GP2P55259 537 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 BTG1P62324 171 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 NEDD8Q15843 81 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 FAM201AQ5SY85 155 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ANGPTL5Q86XS5 388 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 LRRC29Q8WV35 223 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 MUL1Q969V5 352 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 PKIBQ9C010 78 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 NEK6Q9HC98 313 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 NOX4Q9NPH5 578 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 CKLFQ9UBR5 152 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 CEACAM18A8MTB9 384 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 A8MXK9 166 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SYNGR1O43759 233 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ALDOBP05062 364 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 HCKP08631 526 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 UCHL1P09936 223 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TGFBR2P37173 567 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 MTCP1P56278 107 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 FGF12P61328 243 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 PPP3R1P63098 170 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 FABP5Q01469 135 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 IL24Q13007 206 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 C2orf68Q2NKX9 166 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 RNF144BQ7Z419 303 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SPACA5Q96QH8 159 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TMEM165Q9HC07 324 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 FOXJ3Q9UPW0 622 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 RYR2Q92736 4967 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 LGALS8O00214 317 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 GABRPO00591 440 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 AKR7A2O43488 359 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 WNT2P09544 360 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 PGA5P0DJD9 388 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SMIM18P0DKX4 95 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 GALP22466 123 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 BDKRB2P30411 391 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 KISS1Q15726 138 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TMEM155Q4W5P6 130 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ESCO2Q56NI9 601 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TEX36Q5VZQ5 186 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 PDZD9Q8IXQ8 264 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 POC1AQ8NBT0 407 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 PHYHIPQ92561 330 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 OOEPA6NGQ2 149 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 MAGEB3O15480 346 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 MPIG6BO95866 241 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 OPN1MWP04001 364 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ERVK11-1P61568 191 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 ZNF404Q494X3 552 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 MKXQ8IYA7 352 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 C19orf18Q8NEA5 215 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 RFT1Q96AA3 541 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SEH1LQ96EE3 360 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms