RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SPATA24Q86W54 205 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 RFT1Q96AA3 541 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 PKIBQ9C010 78 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 hADV38S2A0JD32 116 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.93□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-7P01780 117 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ANXA8P13928 327 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 OR3A1P47881 315 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 POU3F4P49335 361 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DYNLT3P51808 116 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.93□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.93□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 RYR2Q92736 4967 aa8.93□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SYT7O43581 403 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ENTPD6O75354 484 aa8.92□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 HTR1DP28221 377 aa8.92□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 FAHD1Q6P587 224 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZSR3 168 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ZNF329Q86UD4 541 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DTX3Q8N9I9 347 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 STMN2Q93045 179 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 LEAP2Q969E1 77 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DUX3Q96PT4 197 aa8.92□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 CLN6Q9NWW5 311 aa8.92□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.92□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.92□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.91□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1D-12P01611 117 aa8.91□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 OR3A4PP47883 348 aa8.91□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 TP53I3Q53FA7 332 aa8.91□□□□□ -0.98
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ACTB-209ENST00000473257 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 TEX12Q9BXU0 123 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DPM3Q9P2X0 92 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.91□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 KRT8P05787 483 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
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