RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR5A2Q8NGI9 324 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MARCH1Q8TCQ1 289 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SARAFQ96BY9 339 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS9Q9BPW9 319 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PKIBQ9C010 78 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR51I2Q9H344 312 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LDAHQ9H6V9 325 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf49Q9H741 205 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IFT46Q9NQC8 304 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MTCH1Q9NZJ7 389 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 EDARQ9UNE0 448 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MPC1Q9Y5U8 109 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CACNA1AO00555 2505 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00862A6NCI5 91 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR5B21A6NL26 309 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RFPL4AA6NLU0 287 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IQCF6A8MYZ5 107 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 F5H5P2 479 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SNAPC5O75971 98 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 HTR3BO95264 441 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SFT2D2O95562 160 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CFDP00746 253 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GLAP06280 429 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LYL1P12980 280 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RAC2P15153 192 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RPA2P15927 270 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CBR1P16152 277 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 AMY2BP19961 511 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FUT3P21217 361 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R31P59538 309 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PLP2Q04941 152 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IL24Q13007 206 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ARFRP1Q13795 201 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RSU1Q15404 277 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf46Q504U0 113 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM128Q5BJH2 165 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR2A2Q6IF42 318 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 Q6P435 159 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 VWA1Q6PCB0 445 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TEX261Q6UWH6 196 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FTMTQ8N4E7 242 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR51F2Q8NH61 342 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PIGCQ92535 297 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 STARD4Q96DR4 205 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CHIAQ9BZP6 476 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FXYD6Q9H0Q3 95 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PPA2Q9H2U2 334 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RHOFQ9HBH0 211 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A11Q9UPY5 501 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 U3KQ87 197 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ITPR1Q14643 2758 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LAMA5O15230 3695 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CADP27708 2225 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RNF222A6NCQ9 220 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 POM121CA8CG34 1229 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF732B4DXR9 585 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 J3QT63 122 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GOSR2O14653 212 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SYNGR1O43759 233 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 B3GALNT1O75752 331 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TUSC2O75896 110 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LYZL6O75951 148 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A5O76082 557 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CSN2P05814 226 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 WNT2P09544 360 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 BCL3P20749 454 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 KITLGP21583 273 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TUBG1P23258 451 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GABRR1P24046 479 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms