RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 TTLQ8NG68 377 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF461Q8TAF7 563 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 CCL17Q92583 94 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM210AQ96ND0 272 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 SCN1AP35498 2009 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO3BQ8WXR4 1341 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 C7orf66A4D0T2 115 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 C9J4A7 227 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 COCHO43405 550 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 SYNGR1O43759 233 aa3.23□□□□□ -1.89
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RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1CAP62136 330 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ADIGQ0VDE8 80 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 Q499Y3 187 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 CLLU1OSQ5K130 101 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 PRNTQ86SH4 94 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 PITX2Q99697 317 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 DOK1Q99704 481 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 APOL4Q9BPW4 351 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ASB7Q9H672 318 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 RDH14Q9HBH5 336 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM72A0PK05 275 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 FFAR1O14842 300 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB36O95755 333 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ORM1P02763 201 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK1P06493 297 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 OR4Q2P0C623 313 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF806P0C7X5 589 aa3.22□□□□□ -1.89
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RABGGTB-205ENST00000462042 SLC18A1P54219 525 aa3.22□□□□□ -1.89
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RABGGTB-205ENST00000462042 ACTBL2Q562R1 376 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 TPGS1Q6ZTW0 290 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 LFNGQ8NES3 379 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 OR5T1Q8NG75 326 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 C17orf50Q8WW18 174 aa3.22□□□□□ -1.89
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RABGGTB-205ENST00000462042 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.22□□□□□ -1.89
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RABGGTB-205ENST00000462042 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ING2Q9H160 280 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-205ENST00000462042 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV1-39P01597 117 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CD74P04233 296 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV1D-39P04432 117 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 IL1RNP18510 177 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 RHOAP61586 193 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 BNIP2Q12982 314 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF404Q494X3 552 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CDKL4Q5MAI5 379 aa3.21□□□□□ -1.9
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RABGGTB-205ENST00000462042 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.21□□□□□ -1.9
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RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM151BQ6UXP7 276 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01560Q8TB33 94 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.21□□□□□ -1.9
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RABGGTB-205ENST00000462042 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 DDIT4LQ96D03 193 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PARP11Q9NR21 331 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 NAGKQ9UJ70 344 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.21□□□□□ -1.9
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