RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	CHST4	Q8NCG5	386 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	GPER1	Q99527	375 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	DUX4	Q9UBX2	424 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0A6YYJ9	748 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PPH5	198 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241		F8VVB4	439 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241		F8VWA3	439 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	GABRP	O00591	440 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SH2D1B	O14796	132 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1D-12	P01611	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	TK1	P04183	234 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFB7	P17568	137 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	PRKACA	P17612	351 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	GABRA5	P31644	462 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	PTGFR	P43088	359 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	FGF12	P61328	243 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	GPR176	Q14439	515 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SATL1	Q86VE3	508 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	PHC2	Q8IXK0	858 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	RFT1	Q96AA3	541 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	SNX22	Q96L94	193 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	NUP50	Q9UKX7	468 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241		M0R1W7	72 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	HAX1	O00165	279 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	PIN1P1	O15428	100 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	ANGPTL7	O43827	346 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF737	O75373	536 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	HAND1	O96004	215 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	SFTPB	P07988	381 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	UCHL1	P09936	223 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	HSMCR30	P0CW71	290 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	SELL	P14151	372 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	MMP9	P14780	707 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	EPHA1	P21709	976 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	GAL	P22466	123 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	FPR2	P25090	351 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	LMO1	P25800	156 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	CAPZA1	P52907	286 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	COL10A1	Q03692	680 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	IL13RA2	Q14627	380 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	PDCD1	Q15116	288 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	USP43	Q70EL4	1123 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	OR8H2	Q8N162	312 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	WDFY2	Q96P53	400 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	S100A13	Q99584	98 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	TMED9	Q9BVK6	235 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	SIRPD	Q9H106	197 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	METTL9	Q9H1A3	318 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	NOX4	Q9NPH5	578 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	ARL6IP5	O75915	188 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	TOX4	O94842	621 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	RANBP1	P43487	201 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	MAP2K4	P45985	399 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	RSU1	Q15404	277 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF773	Q6PK81	442 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00596	Q86U02	117 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	SPART	Q8N0X7	666 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	ATR	Q13535	2644 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	MGST3	O14880	152 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	RBP4	P02753	201 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PTPA-222	ENST00000445241	CSN2	P05814	226 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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