RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRTN3P24158 256 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VHLP40337 213 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNJ3P48549 501 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2E1P51965 193 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GMFBP60983 142 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARF6P62330 175 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC35A2P78381 396 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR20EP86478 221 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR20CP86479 221 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR20DP86480 221 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR20BP86481 221 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR20AP86496 221 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR176Q14439 515 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL13RA2Q14627 380 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAM1Q15629 374 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELP2Q6IA86 826 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00596Q86U02 117 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD177Q8N6Q3 437 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NRG4Q8WWG1 115 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GHSRQ92847 366 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A28Q96A46 364 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEH1LQ96EE3 360 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HMG20AQ9NP66 347 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.06□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1B0GW55 424 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 hADV38S2A0JD32 116 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MEGF11A6BM72 1044 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H3BSH0 61 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MGST3O14880 152 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FCN3O75636 299 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VENTXO95231 258 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP6V1G2O95670 118 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBP1P09467 338 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM225BP0DP42 221 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SELLP14151 372 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRKACAP17612 351 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMO1P25800 156 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BDKRB2P30411 391 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVFRD-1P60508 538 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZP1P60852 638 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAX5Q02548 391 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL10A1Q03692 680 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DOC2BQ14184 412 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPHARQ15513 63 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MIDNQ504T8 468 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHC2Q8IXK0 858 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q8NFD4 153 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHYHIPQ92561 330 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF488Q96MN9 340 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPER1Q99527 375 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 S100A13Q99584 98 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MDFIQ99750 246 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUSP21Q9H596 190 aa7.05□□□□□ -1.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX4Q9UBX2 424 aa7.05□□□□□ -1.28
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