RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASB7Q9H672 318 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP3M1Q9Y2T2 418 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACOT9Q9Y305 439 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 INSIG2Q9Y5U4 225 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSH2Q76I76 1423 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0J9YYE9 177 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYBPHLA2RUH7 354 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC14L6B5MCN3 397 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 GGTLC3B5MD39 225 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7EPK0 472 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS5O15539 181 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSCAO43653 123 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 GMDSO60547 372 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDS2O95674 445 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBC1P01850 177 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHOCP08134 193 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD9P21926 228 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFFO1Q0D2I5 559 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSX1Q16384 188 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF404Q494X3 552 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 NELFCDQ8IXH7 590 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPNE9Q8IYJ1 553 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 C3orf22Q8N5N4 141 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANP32EQ9BTT0 268 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIGD2AQ9BW72 106 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRRQ9GZT4 340 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC38A1Q9H2H9 487 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 C12orf4Q9NQ89 552 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDIT4Q9NX09 232 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLVCR2Q9UPI3 526 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PNM2 257 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2AT4A6NND4 320 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 LEUTXA8MZ59 168 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7ERS5 55 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 UPK2O00526 184 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISLRO14498 428 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDELR3O43731 214 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHRS3O75911 302 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBP02144 154 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYGCP07315 174 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPN2P22792 545 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 IMPA1P29218 277 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARR3P36575 388 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR4P46093 362 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 LGALS7P47929 136 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK38Q15208 465 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAL2Q16559 108 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFAF6Q330K2 333 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 UGT2A3Q6UWM9 527 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZQT7 251 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMN1Q8IY45 258 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR8S1Q8NH09 359 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 FXYD5Q96DB9 178 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHID1Q9BWS9 393 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 PORCNQ9H237 461 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXNIPQ9H3M7 391 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRORYQ9H606 182 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDHAF3Q9NRP4 125 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICOSQ9Y6W8 199 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOCK6Q96HP0 2047 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 LTBP2Q14767 1821 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF27Q86VH2 1401 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC5A10A0PJK1 596 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD300LBA8K4G0 201 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC31A1O15431 190 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 GYG2O15488 501 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 COX7A2P2O60397 106 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTCP00480 354 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 RLN2P04090 185 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIPCP11150 499 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 MLNP12872 115 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAC1P20366 129 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q499Y3 187 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTMPQ5BVD1 217 aa1.01□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms