RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SDSLQ96GA7 329 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF488Q96MN9 340 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF649Q9BS31 505 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RASL12Q9NYN1 266 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 M0R1W7 72 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OGG1O15527 345 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 WIPF1O43516 503 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MPZP25189 248 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RBP2P50120 134 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CAPZA1P52907 286 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ATP1B3P54709 279 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PPP3R1P63098 170 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 KLRD1Q13241 179 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SPHARQ15513 63 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CALHM1Q8IU99 346 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 BATF2Q8N1L9 274 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM86BQ8N661 226 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CD177Q8N6Q3 437 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N7P7 452 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FCGR1BQ92637 280 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 UFD1Q92890 307 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 BORCS8Q96FH0 119 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CHIAQ9BZP6 476 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PKIBQ9C010 78 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RHOFQ9HBH0 211 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.29□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NOTCH1P46531 2555 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NPFFO15130 113 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SULT1B1O43704 296 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV4-59P01825 116 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FBP1P09467 338 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CELP19835 753 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RAB3AP20336 220 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OMGP23515 440 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRDX2P32119 198 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 BMXP51813 675 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DLX1P56177 255 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MTCP1P56278 107 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 IL24Q13007 206 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 BLMHQ13867 455 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MED22Q15528 200 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2V2Q15819 145 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 Q499Y3 187 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf87Q6PH81 154 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MKXQ8IYA7 352 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RDH10Q8IZV5 341 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF561Q8N587 486 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PHYHIPQ92561 330 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GHSRQ92847 366 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM106AQ96A25 262 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SLAMF9Q96A28 289 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FGGYQ96C11 551 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OPALINQ96PE5 141 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF747Q9BV97 191 aa6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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