RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf62Q8N4C0 152 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR2M5A3KFT3 312 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DRB3P79483 266 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A42Q86VD7 318 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 NAT8BQ9UHF3 227 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 MBPP02686 304 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL3P19876 107 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR10G4Q8NGN3 311 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR10G9Q8NGN4 311 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR10G7Q8NGN6 311 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 RASL10BQ96S79 203 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 STARD10Q9Y365 291 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPV9 198 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 M0QZ24 198 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 COL19A1Q14993 1142 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 STRCQ7RTU9 1775 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF83P51522 516 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OPRK1P41145 380 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC29Q8WV35 223 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC1BQ9P126 229 aa18.69■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 VDAC1P21796 283 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 PTTG1IPP53801 180 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM20LQ6UXN7 152 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 VPS25Q9BRG1 176 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM218A2RU14 115 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 RBFOX3A6NFN3 312 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB108AA8MXU0 73 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 PMCHP20382 165 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 MPLP40238 635 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 GNG4P50150 75 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 SKP2Q13309 424 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 BVESQ8NE79 360 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR3A1P47881 315 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR4F17Q8NGA8 305 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK15Q9H427 330 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 GPR27Q9NS67 375 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C3Q9NZP0 311 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 hADV38S2A0JD32 116 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 K7EQS6 105 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H3AP68431 136 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 PARD6AQ9NPB6 346 aa18.68■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 NINQ8N4C6 2090 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TRDCB7Z8K6 153 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 SOCS1O15524 211 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PN81 502 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OPN1MWP04001 364 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 CST2P09228 141 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA7P36544 502 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM91Q6ZNR0 172 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR2Y1Q8NGV0 311 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 CXXC4Q9H2H0 198 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 IL36GQ9NZH8 169 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 SYNGR2O43760 224 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 PATE4P0C8F1 98 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-GP17693 338 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 GNG10P50151 68 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR10AC1Q8NH08 325 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF79Q15937 498 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 D2HGDHQ8N465 521 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 HES7Q9BYE0 225 aa18.67■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 HPXP02790 462 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS13Q6UX07 377 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 ASB5Q8WWX0 329 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 RPEQ96AT9 228 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A22Q9H936 323 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 NTMQ9P121 344 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR5H1A6NKK0 313 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TOX4O94842 621 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 RNF133Q8WVZ7 376 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PR80 420 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF785A8K8V0 405 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 RBP4P02753 201 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 MMP16P51512 607 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D26Q86UD7 250 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 GLRX2Q9NS18 164 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 USP54Q70EL1 1684 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 LEUTXA8MZ59 168 aa18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 NRTNQ99748 197 aa18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.8 ms