RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SSSCA1O60232 199 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OMGP23515 440 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 HAAOP46952 286 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PRDX4Q13162 271 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF611Q8N823 705 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SAP25Q8TEE9 199 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PFDN5Q99471 154 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 A0A0J9YW62 118 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 C5orf49A4QMS7 147 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR2C1O95371 312 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 COL19A1Q14993 1142 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ACER2Q5QJU3 275 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR10C1Q96KK4 312 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RAB40CQ96S21 281 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR5B21A6NL26 309 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF732B4DXR9 585 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ONECUT2O95948 504 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 IL24Q13007 206 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MOB3AQ96BX8 217 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 BTF3L4Q96K17 158 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 UCN2Q96RP3 112 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PRR13Q9NZ81 148 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FAM221AA4D161 298 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR13C7P0DN81 318 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 COX6A1P12074 109 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 LYL1P12980 280 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PTGER4P35408 488 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 UBE2V2Q15819 145 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SP6Q3SY56 376 aa7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PTPRSQ13332 1948 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
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HERC3-201ENST00000264345 RNF212Q495C1 297 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PMS2CLQ68D20 193 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SMIM8Q96KF7 97 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 IFT22Q9H7X7 185 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PP11 408 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 DBX1A6NMT0 343 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PPYP01298 95 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R30P59541 319 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 GNG3P63215 75 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 C12orf57Q99622 126 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RNF126Q9BV68 326 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ENY2Q9NPA8 101 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TMEM100Q9NV29 134 aa7.71□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQM1 296 aa7.71□□□□□ -1.18
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HERC3-201ENST00000264345 SH2D1BO14796 132 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TMEM187Q14656 261 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 NRN1LQ496H8 165 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TVP23CQ96ET8 276 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 COX5BP10606 129 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RRADP55042 308 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 GUCA2BQ16661 112 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CLDN23Q96B33 292 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 GALNT14Q96FL9 552 aa7.71□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.71□□□□□ -1.18
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