RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	GPR132	Q9UNW8	380 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	PMP2	P02689	132 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	LIF	P15018	202 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	LMO1	P25800	156 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	THBS4	P35443	961 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	CAMLG	P49069	296 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659		A6NIZ1	184 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	RAP1B	P61224	184 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ST7L	Q8TDW4	575 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	FBXL17	Q9UF56	701 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659		G3V3Y1	287 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	HCK	P08631	526 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	TCF15	Q12870	199 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PNV4	684 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659		B4DEV8	164 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	STMND1	H3BQB6	276 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SLC16A7	O60669	478 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MB	P02144	154 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	OPN1LW	P04000	364 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659		P04436	131 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	S100A10	P60903	97 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	HSF1	Q00613	529 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	TNFRSF9	Q07011	255 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ELOB	Q15370	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ASB5	Q8WWX0	329 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PSMF1	Q92530	271 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PNR3	127 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CBR3	O75828	277 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	BPNT1	O95861	308 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	SOD3	P08294	240 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	FCGR2C	P31995	323 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	CASP6	P55212	293 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	OR51F2	Q8NH61	342 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GTH9	108 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-225	ENST00000630659	ZIC3	O60481	467 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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