RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYBA2	P53672	197 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10A3	P58181	314 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SELENOT	P62341	195 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC22A25	Q6T423	547 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	CMBL	Q96DG6	245 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	MED29	Q9NX70	200 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NIZ1	184 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM183A	A6NL82	134 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	IL18BP	O95998	194 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	PNP	P00491	289 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	GAST	P01350	101 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	LIMS3	P0CW19	117 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	LIMS4	P0CW20	117 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	CEL	P19835	753 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	EDNRA	P25101	427 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	AKR1C3	P42330	323 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	VAMP2	P63027	116 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	MEF2D	Q14814	521 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2V2	Q15819	145 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ODF4	Q2M2E3	257 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	PRODH	O43272	600 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SYT7	O43581	403 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BK	O60814	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SMPD2	O60906	423 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	LYZL6	O75951	148 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	SOX14	O95416	240 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BO	P23527	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BB	P33778	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNGR2	P38484	337 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	LHX2	P50458	406 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BD	P58876	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BC	P62807	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPAN31	Q12999	210 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF141	Q15928	474 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP6V1F	Q16864	119 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF529	Q6P280	563 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	NRM	Q8IXM6	262 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC107	Q8WV48	283 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT11	Q96G61	164 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	INTS14	Q96SY0	518 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	CSTL1	Q9H114	145 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WZY1	265 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A096LPE4	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0G2JK05	382 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PPZ6	126 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LETMD1-238	ENST00000623495	C20orf202	A1L168	122 aa		6.32	□□□□□ -1.4

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