RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 F8VVB4 439 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 F8VWA3 439 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRF-216ENST00000617451 PEX14O75381 377 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 CCL1P22362 96 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 BLCAPP62952 87 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRF-216ENST00000617451 TCF23Q7RTU1 214 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 OR8H2Q8N162 312 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa20.02■□□□□ 0.8
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PTPRF-216ENST00000617451 NDNFQ8TB73 568 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRF-216ENST00000617451 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC7AQ9BXN2 247 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRF-216ENST00000617451 CHST5Q9GZS9 411 aa19.98■□□□□ 0.79
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