RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A0G2JMM0	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PPB8	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PRS3	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	IFNA5	P01569	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV3-13	P01766	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ARG1	P05089	322 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	GP1BA	P07359	652 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	LGI3	Q8N145	548 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	OR6S1	Q8NH40	331 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	SDSL	Q96GA7	329 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	THBS4	P35443	961 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF273	Q14593	569 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ABCA4	P78363	2273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	SOX15	O60248	233 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	FST	P19883	344 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	MPG	P29372	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	PCBD1	P61457	104 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	PP6455	Q8WZ26	134 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	EXTL1	Q92935	676 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	NPTN	Q9Y639	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	CER1	O95813	267 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	OR2T2	Q6IF00	324 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	FZR1	Q9UM11	496 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1B0GTI1	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449		G3V3Q6	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	NPBWR1	P48145	328 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	AVPI1	Q5T686	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	CDH20	Q9HBT6	801 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A0U1RQK1	487 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	HP	P00738	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	P2RY4	P51582	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	NHLH2	Q02577	135 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A0A6YYD4	124 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	MSTN	O14793	375 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	TBP	P20226	339 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	TESK1	Q15569	626 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	NINJ1	Q92982	152 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		11.15	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNJ3	P48549	501 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	RAB1A	P62820	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF92	Q03936	586 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ACSS3-208	ENST00000616449	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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