RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587259.5

VMP1-204, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene VMP1, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-204ENST00000587259 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 CA10Q9NS85 328 aa6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.66□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 A0A0B4J203 849 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 H3BSH0 61 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 H3BUI4 141 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 WNT9BO14905 357 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 LDLRAD4O15165 306 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 RBBP9O75884 186 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 LPLP06858 475 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 CECR9P0C854 216 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 CD79AP11912 226 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 DAOP14920 347 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 EGR1P18146 543 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 PRSS3P35030 304 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 GDNFP39905 211 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 RAG2P55895 527 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 CLDN12P56749 244 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 RAB1AP62820 205 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 HGFACQ04756 655 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 OR8B8Q15620 311 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 MSMPQ1L6U9 139 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 KRT74Q7RTS7 529 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 LYPD6Q86Y78 171 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 SLC25A28Q96A46 364 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 ABHD1Q96SE0 405 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
VMP1-204ENST00000587259 DYSFO75923 2080 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 ICMTO60725 284 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 KDM4BO94953 1096 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 DHFRP00374 187 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 DBHP09172 617 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 TBPP20226 339 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 CPT2P23786 658 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 SLC6A1P30531 599 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 RCVRNP35243 200 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 RBP2P50120 134 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 FUT6P51993 359 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 BTG1P62324 171 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 DGCR2P98153 550 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 NAAAQ02083 359 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 ZMYND11Q15326 602 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 KISS1Q15726 138 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 OR5AS1Q8N127 324 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 SGK3Q96BR1 496 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 BORCS8Q96FH0 119 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 LYZL4Q96KX0 146 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 PLK3Q9H4B4 646 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.64□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.63□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 C5orf49A4QMS7 147 aa6.63□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.63□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 FAM157AC9JC47 383 aa6.63□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 NDUFS8O00217 210 aa6.63□□□□□ -1.35
VMP1-204ENST00000587259 PLA2G10O15496 165 aa6.63□□□□□ -1.35
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