RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 TMEM106AQ96A25 262 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SPSB1Q96BD6 273 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SMIM19Q96E16 107 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 GAFA1Q96PS6 74 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SPACA5Q96QH8 159 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MND1Q9BWT6 205 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 Q9H521 79 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 GLS2Q9UI32 602 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 RAB26Q9ULW5 256 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.45□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 A0A1B0GW55 424 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ZNF879B4DU55 563 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 C22orf46C9J442 243 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SIGLEC5O15389 551 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 OGG1O15527 345 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 RGS10O43665 173 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ANGPTL7O43827 346 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 KNG1P01042 644 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CDK1P06493 297 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SELLP14151 372 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PRKACAP17612 351 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CELP19835 753 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MPZP25189 248 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FGF12P61328 243 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 BLMHQ13867 455 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MED22Q15528 200 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PRR31Q5SQ13 230 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 GPR157Q5UAW9 335 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FGFRL1Q8N441 504 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 GHSRQ92847 366 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 S100A13Q99584 98 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CKLFQ9UBR5 152 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DUX4Q9UBX2 424 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 OPN4Q9UHM6 478 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 NUP50Q9UKX7 468 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 A0A1W2PPH5 198 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 LALBAP00709 142 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MT-ND2P03891 347 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CHRM2P08172 466 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 HSMCR30P0CW71 290 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CALCBP10092 127 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 AMY2BP19961 511 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 BCL3P20749 454 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CAV3P56539 151 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ERVK11-1P61568 191 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PAX2Q02962 417 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 COL10A1Q03692 680 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 SCN1BQ07699 218 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 PDCD1Q15116 288 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 KISS1Q15726 138 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DGUOKQ16854 277 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 Q499Y3 187 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 CD177Q8N6Q3 437 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMG6-211ENST00000572369 THRSPQ92748 146 aa6.43□□□□□ -1.38
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