RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 LYG1Q8N1E2 194 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 TMEM163Q8TC26 289 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 R3HDM4Q96D70 268 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 SNX22Q96L94 193 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 CEP19Q96LK0 163 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 OR4F4Q96R69 305 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 ZNF702PQ9H963 129 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 TCF19Q9Y242 345 aa6.59□□□□□ -1.35
COCH-211ENST00000557065 A6NDX4 124 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 METTL15A6NJ78 407 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 G3V2T6 193 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 PIN1P1O15428 100 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 SYT7O43581 403 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ZNF737O75373 536 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 CYB5AP00167 134 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ALDOBP05062 364 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 PEX2P28328 305 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ATP6V1E1P36543 226 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 FUT6P51993 359 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 LOXL3P58215 753 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 SLC34A1Q06495 639 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 UBE2V2Q15819 145 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ODF4Q2M2E3 257 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ZNF626Q68DY1 528 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 Q6ZSR3 168 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 TMEM219Q86XT9 240 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 GID4Q8IVV7 300 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 OR8H2Q8N162 312 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ZNF714Q96N38 554 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 OR5M11Q96RB7 305 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 MMP28Q9H239 520 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 KRT84Q9NSB2 600 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 GLS2Q9UI32 602 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 POMPQ9Y244 141 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.58□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 MEGF11A6BM72 1044 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ODF3BA8MYP8 253 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 F8VVB4 439 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 F8VWA3 439 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 F2RL2O00254 374 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 SULT1C4O75897 302 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 OR2T7P0C7T2 308 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 CCL1P22362 96 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 GABRR1P24046 479 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ACTA2P62736 377 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 BLCAPP62952 87 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ACTG2P63267 376 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ACTC1P68032 377 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ACTA1P68133 377 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 IL18R1Q13478 541 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 EDDM3AQ14507 147 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 GRK1Q15835 563 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 C12orf73Q69YU5 71 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 Q6ZPA2 131 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 Q8IYB0 196 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 NDNFQ8TB73 568 aa6.57□□□□□ -1.36
COCH-211ENST00000557065 MRAPQ8TCY5 172 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms