RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540931.1

CLSTN3-210, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CLSTN3, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-210ENST00000540931 ZNF561Q8N587 486 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 CHST4Q8NCG5 386 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 MRI1Q9BV20 369 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 SH2D1BO14796 132 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 PLATP00750 562 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 WNT2P09544 360 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 GTF2F2P13984 249 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 RAB3BP20337 219 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 CFPP27918 469 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 HTR2CP28335 458 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 FGF12P61328 243 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 LMO4P61968 165 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 ZNF146Q15072 292 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 STUMQ69YW2 141 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 AWAT2Q6E213 333 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 C22orf42Q6IC83 251 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 BIVMQ86UB2 503 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 TEX29Q8N6K0 151 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 SLAMF9Q96A28 289 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 YIPF6Q96EC8 236 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 SPACA5Q96QH8 159 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 HMG20AQ9NP66 347 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 CLN8Q9UBY8 286 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 FBN3Q75N90 2809 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-210ENST00000540931 A0A096LNT2 108 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 SLC17A2O00624 439 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 TMPRSS2O15393 492 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 ADAM20O43506 726 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 NDUFB3O43676 98 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 INHBBP09529 407 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 CD80P33681 288 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 IL13RA2Q14627 380 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 INSL4Q14641 139 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 DGUOKQ16854 277 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 RFT1Q96AA3 541 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 SDSLQ96GA7 329 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 ING4Q9UNL4 249 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 A8MXK9 166 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 SLC22A1O15245 554 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 SIGLEC5O15389 551 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 LIPFP07098 398 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 PSG2P11465 335 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 PRKACAP17612 351 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 EGR1P18146 543 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 GADD45AP24522 165 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 PRDX2P32119 198 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 ALDH3B2P48448 385 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 PITPNBP48739 271 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 SCAND1P57086 179 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 GNB2P62879 340 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-210ENST00000540931 LYPD6Q86Y78 171 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms