RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 ACRV1P26436 265 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PSMB5P28074 263 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 P2RY2P41231 377 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 CRYBA4P53673 196 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PFN3P60673 137 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 RHOBP62745 196 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 SPEM2Q0P670 501 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PMPCAQ10713 525 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 FOXL1Q12952 345 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 RAB31Q13636 194 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 MPV17LQ2QL34 196 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 SPATA45Q537H7 98 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TP53I3Q53FA7 332 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 Q6ZWC4 215 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 CALHM1Q8IU99 346 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 OR6N2Q8NGY6 317 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 OR8S1Q8NH09 359 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 OR4K13Q8NH42 304 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 FGF13Q92913 245 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 GLYATL1Q969I3 302 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 STARD4Q96DR4 205 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 RAX2Q96IS3 184 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 SLC35G5Q96KT7 338 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 RASL10BQ96S79 203 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TBX5Q99593 518 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 OR51I2Q9H344 312 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 C1RLQ9NZP8 487 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 WNT16Q9UBV4 365 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 AK3Q9UIJ7 227 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 KLK13Q9UKR3 277 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 WDR45Q9Y484 360 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.39□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 ARL5CA6NH57 179 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 LIPT2A6NK58 231 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 C4orf47A7E2U8 309 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 M0R296 226 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 SLC17A3O00476 420 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 GRM6O15303 877 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 NPIPB7O75200 414 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF253O75346 499 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 DBHP09172 617 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 ERGP11308 486 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PSG1P11464 419 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 IL9P15248 144 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 KLK2P20151 261 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 CD22P20273 847 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 AADACP22760 399 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TUBG1P23258 451 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 SFTPDP35247 375 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 GRK6P43250 576 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 GALR1P47211 349 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 REG1BP48304 166 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 LSSP48449 732 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 GPM6AP51674 278 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PIGPP57054 158 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 FXYD6P3P58550 94 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TAS2R46P59540 309 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 LILRA4P59901 499 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 SEC11AP67812 179 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 RUNX1Q01196 453 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TLE3Q04726 772 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 MSMO1Q15800 293 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 TDRG1Q3Y452 100 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 Q5PR19 223 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.38□□□□□ -1.55
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
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