RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	HES4	Q9HCC6	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ING4	Q9UNL4	249 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CACNG2	Q9Y698	323 aa		12.82	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ZAN	Q9Y493	2812 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	NOTO	A8MTQ0	251 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SLC17A2	O00624	439 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SH2D1B	O14796	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SYNGR1	O43759	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	RHBDL1	O75783	438 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	IL1A	P01583	271 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CHRM2	P08172	466 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	INHBB	P09529	407 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CD37	P11049	281 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CFP	P27918	469 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	TMBIM6	P55061	237 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SCAND1	P57086	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FGF12	P61328	243 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ERVK11-1	P61568	191 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	DGUOK	Q16854	277 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SPRN	Q5BIV9	151 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CHST4	Q8NCG5	386 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SLAMF9	Q96A28	289 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		12.81	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	OR2AT4	A6NND4	320 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	C3orf80	F5H4A9	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	AIP	O00170	330 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SLC22A1	O15245	554 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FOXH1	O75593	365 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	GABARAP	O95166	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	GZMK	P49863	264 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	IL13RA2	Q14627	380 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ZMYND11	Q15326	602 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ESCO2	Q56NI9	601 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	GPR107	Q5VW38	600 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	USP43	Q70EL4	1123 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF561	Q8N587	486 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730		Q8NFD4	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM165	Q9HC07	324 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	HMG20A	Q9NP66	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	IFITM5	A6NNB3	132 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	HTR3B	O95264	441 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ARSB	P15848	533 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	PRKACA	P17612	351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CD80	P33681	288 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SDC2	P34741	201 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	OR3A4P	P47883	348 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	IL13RA1	P78552	427 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF146	Q15072	292 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	MPV17L	Q2QL34	196 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	AVPI1	Q5T686	147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CD276	Q5ZPR3	534 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	OSR2	Q8N2R0	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	ORAI1	Q96D31	301 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BBS1-224	ENST00000534730	CENPO	Q9BU64	300 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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