RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 TTRP02766 147 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 RIDAP52758 137 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP10-11P60412 298 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 ESRRGP62508 458 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 ACTA2P62736 377 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 ACTG2P63267 376 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 ACTC1P68032 377 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 ACTA1P68133 377 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 APOFQ13790 326 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 ANGPTL5Q86XS5 388 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 NDNFQ8TB73 568 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 ASB17Q8WXJ9 295 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF714Q96N38 554 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 PKIBQ9C010 78 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRU-210ENST00000527027 PRR32B1ATL7 298 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 E2F6O75461 281 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CST1P01037 141 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 RAP2AP10114 183 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 OSMP13725 252 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 MS4A2Q01362 244 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 IL24Q13007 206 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 OR8H2Q8N162 312 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF676Q8N7Q3 588 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CHID1Q9BWS9 393 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF556Q9HAH1 456 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 DNAJB9Q9UBS3 223 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 IKZF2Q9UKS7 526 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 V9GYS6 101 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1B0GTI1 187 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 hADV38S2A0JD32 116 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 ERICH4A6NGS2 130 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 AQP12BA6NM10 295 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 IL18R1Q13478 541 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 TCF23Q7RTU1 214 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 AQP12AQ8IXF9 295 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 ELMOD2Q8IZ81 293 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 OR14K1Q8NGZ2 314 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 MYDGFQ969H8 173 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 AKR1E2Q96JD6 320 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 SNX22Q96L94 193 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 TEX12Q9BXU0 123 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 MOB1AQ9H8S9 216 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 INPP5EQ9NRR6 644 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 COPS3Q9UNS2 423 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 A6NIN4 97 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 F8VVB4 439 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 F8VWA3 439 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 GNGT2O14610 69 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CLIC3O95833 236 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 HTR1DP28221 377 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 FLOT2Q14254 428 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 BCL2L15Q5TBC7 163 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 Q6ZSR3 168 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CAPSLQ8WWF8 208 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CEP19Q96LK0 163 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CLEC7AQ9BXN2 247 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 TTTY10Q9BZA0 68 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 LIN7BQ9HAP6 207 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 MTCH1Q9NZJ7 389 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 OR52A1Q9UKL2 312 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 SLC7A11Q9UPY5 501 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 POMPQ9Y244 141 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM82A0PJX8 343 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC182A6NF36 153 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 LPLP06858 475 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 BRS3P32247 399 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 ACTR3P61158 418 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 CD69Q07108 199 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 EDDM3AQ14507 147 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 SNAPC1Q16533 368 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 C1orf146Q5VVC0 180 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 OR4X2Q8NGF9 303 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 STMN2Q93045 179 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 APOL4Q9BPW4 351 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRU-210ENST00000527027 R4GMQ9 66 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms