RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505507.6

PDE4D-213, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-213ENST00000505507 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 NIPAL2Q9H841 368 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 MED20Q9H944 212 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 WDR76Q9H967 626 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 CENPMQ9NSP4 180 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 SCN3BQ9NY72 215 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 RAB26Q9ULW5 256 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-213ENST00000505507 GTF3C1Q12789 2109 aa3.13□□□□□ -1.91
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PDE4D-213ENST00000505507 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ATMQ13315 3056 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 A0A1W2PR80 420 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 DAPL1A0PJW8 107 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 C5orf49A4QMS7 147 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 TVP23AA6NH52 213 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-213ENST00000505507 F5H5K5 113 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 H3BSA7 217 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 C19orf84I3L1E1 186 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 DCTN6O00399 190 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ABCD4O14678 606 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 RER1O15258 196 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ZNF254O75437 659 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 IGKV3-15P01624 115 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 IGLV1-44P01699 117 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 KRT8P05787 483 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 GYPBP06028 91 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 SELEP16581 610 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 MYL12AP19105 171 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 EDNRAP25101 427 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 DCKP27707 260 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 CDKN1AP38936 164 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-213ENST00000505507 CXCR4P61073 352 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ACTA2P62736 377 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ACTG2P63267 376 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-213ENST00000505507 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 FBXO17Q96EF6 278 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.12□□□□□ -1.91
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PDE4D-213ENST00000505507 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 COQ7Q99807 217 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ATF6BQ99941 703 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 COPS4Q9BT78 406 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 ZFP57Q9NU63 452 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-213ENST00000505507 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.12□□□□□ -1.91
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