RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 MDGA2Q7Z553 956 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SPPL2CQ8IUH8 684 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SFXN5Q8TD22 340 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RGMAQ96B86 450 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35A4Q96G79 324 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GNRHR2Q96P88 292 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF358Q9NW07 568 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OAZ3Q9UMX2 235 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TGFBR3LH3BV60 316 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC1A7O00341 560 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC17A3O00476 420 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNGR3O43761 229 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BKO60814 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HLA-DQB1P01920 261 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BJP06899 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HKR1P10072 659 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BOP23527 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP11P24347 488 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BBP33778 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BDP58876 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BCP62807 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 IRF9Q00978 393 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS8Q16651 343 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 IQCJQ1A5X6 159 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL2L15Q5TBC7 163 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF567Q8N184 647 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL11Q969Q4 196 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 DDOQ99489 341 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MEMO1Q9Y316 297 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GAGE12BA1L429 117 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5B21A6NL26 309 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SCG5P05408 212 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SDC1P18827 310 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GADD45AP24522 165 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GABRA2P47869 451 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CAV2P51636 162 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 DUSP2Q05923 314 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZVH6 145 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CD163Q86VB7 1156 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1L3Q8NH93 324 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF519Q8TB69 540 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF183Q96D59 192 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC61A2Q9H9S3 476 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SERINC4A6NH21 518 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CASKO14936 926 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 IFNA1P01562 189 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR12D1P0DN82 309 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR12D2P58182 307 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MFAP5Q13361 173 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF266Q14584 549 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 POU2AF1Q16633 256 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TDRG1Q3Y452 100 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PYDC2Q56P42 97 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF787Q6DD87 383 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR10K2Q6IF99 312 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GPSM1Q86YR5 675 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms