RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486228.7

CDK20-206, Transcript of cyclin dependent kinase 20, human

TSL 2

Gene CDK20, Length 2,021 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK20-206	ENST00000486228	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	BCO1	Q9HAY6	547 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	MED13	Q9UHV7	2174 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	IFNA2	P01563	188 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	SP1	P08047	785 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	PLGLB1	Q02325	96 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	RAB32	Q13637	225 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	MDS2	Q8NDY4	140 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	CCNO	P22674	350 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	NPBWR2	P48146	333 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	MEOX1	P50221	254 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	GLRX5	Q86SX6	157 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	C17orf50	Q8WW18	174 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	C5orf49	A4QMS7	147 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	ZNF724	A8MTY0	619 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228		B8ZZF3	427 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	NME2P1	O60361	137 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	NME2	P22392	152 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	ECI1	P42126	302 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	STK11	Q15831	433 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	ZNF611	Q8N823	705 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	STOML3	Q8TAV4	291 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	TECTB	Q96PL2	329 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CDK20-206	ENST00000486228	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	PDCD6	O75340	191 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	RNF122	Q9H9V4	155 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	NGF	P01138	241 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SLC22A25	Q6T423	547 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	APH1A	Q96BI3	265 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	CD79A	P11912	226 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	PRDX4	Q13162	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	ELP2	Q6IA86	826 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228		Q8NFD4	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	AQP10	Q96PS8	301 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	STARD10	Q9Y365	291 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	COX5B	P10606	129 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	BCL3	P20749	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	PIGP	P57054	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	RAB1A	P62820	205 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	MALL	Q13021	153 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	TOMM40L	Q969M1	308 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	PRSS50	Q9UI38	385 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	ZNF806	P0C7X5	589 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	ZNF728	P0DKX0	622 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	FUT3	P21217	361 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	FCGR2C	P31995	323 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	GPM6A	P51674	278 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	S100A10	P60903	97 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	NAAA	Q02083	359 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SPEM2	Q0P670	501 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	TGIF1	Q15583	401 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CDK20-206	ENST00000486228	SP6	Q3SY56	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms