RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 HYLS1Q96M11 299 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 KIF25Q9UIL4 384 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 MED12Q93074 2177 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 GPR137BO60478 399 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 GLRXP35754 106 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 CAV2P51636 162 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 F2RL1P55085 397 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 NAA40Q86UY6 237 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 NPTNQ9Y639 398 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00596Q86U02 117 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 PTX4Q96A99 478 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 KLK11Q9UBX7 282 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 HMX3A6NHT5 357 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 IFNL4K9M1U5 179 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 HSD17B6O14756 317 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 FABP7O15540 132 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 CA11O75493 328 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 CCL8P80075 99 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 FAM209AQ5JX71 171 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 VSIG8P0DPA2 414 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 TERB2Q8NHR7 220 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 OR2V2Q96R30 315 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 OR8B2Q96RD0 313 aa7.16□□□□□ -1.26
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