RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482195.5

DDX39B-220, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 1,232 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-220ENST00000482195 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-220ENST00000482195 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
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DDX39B-220ENST00000482195 TENM3Q9P273 2699 aa8.28□□□□□ -1.08
DDX39B-220ENST00000482195 A0A0U1RQV5 110 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 C17orf98A8MV24 154 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 INMTO95050 263 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 MAGEA2P43356 314 aa8.27□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 ACTG2P63267 376 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ACTC1P68032 377 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ACTA1P68133 377 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 CD83Q01151 205 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 LCN8Q6JVE9 175 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 OR8B4Q96RC9 309 aa8.27□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF649Q9BS31 505 aa8.27□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.27□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 DHRS3O75911 302 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ATP6V1B1P15313 513 aa8.26□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 NDE1Q9NXR1 346 aa8.26□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.26□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM82A0PJX8 343 aa8.25□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 K7N7A8 449 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 GNGT2O14610 69 aa8.25□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 CD24P25063 80 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 DYNLT3P51808 116 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ARHGDIBP52566 201 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 IL18R1Q13478 541 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.25□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.25□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.25□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.25□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 STMN2Q93045 179 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 SLAMF9Q96A28 289 aa8.25□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.25□□□□□ -1.09
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DDX39B-220ENST00000482195 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 IFT22Q9H7X7 185 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
DDX39B-220ENST00000482195 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.25□□□□□ -1.09
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