RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 NDNFQ8TB73 568 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MALSU1Q96EH3 234 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 NSL1Q96IY1 281 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 TBX5Q99593 518 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 NDE1Q9NXR1 346 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 V9GYS6 101 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PPE2 198 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PR64 198 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PRV1 198 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ACOD1A6NK06 481 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 DCTN3O75935 186 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MPZP25189 248 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 EPHA2P29317 976 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR12D2P58182 307 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CXCR4P61073 352 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CD83Q01151 205 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 UBE2V2Q15819 145 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 LRGUKQ96M69 825 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 R4GMQ9 66 aa8.97□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 LPLP06858 475 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 PF4V1P10720 104 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V1B1P15313 513 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 GABRR1P24046 479 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 GDNFP39905 211 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 NPBWR2P48146 333 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 RNF144BQ7Z419 303 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 MYDGFQ969H8 173 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CEP19Q96LK0 163 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ZNF714Q96N38 554 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 THTPAQ9BU02 230 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ADGRL4Q9HBW9 690 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ING3Q9NXR8 418 aa8.96□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DLGAP1O14490 977 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 PSPNO60542 156 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ZNF254O75437 659 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 HAND1O96004 215 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CHRM2P08172 466 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 DAPP51397 102 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CRISP1P54107 249 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 IL24Q13007 206 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 GRK1Q15835 563 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 RDH10Q8IZV5 341 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 OR8H2Q8N162 312 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 ASB9Q96DX5 294 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.95□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SIRPB1O00241 398 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 PF4P02776 101 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 AMY1AP04745 511 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 AMY2AP04746 511 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CCDC159P0C7I6 412 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 BCL3P20749 454 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 MNAT1P51948 309 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CBX1P83916 185 aa8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms