RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 AK3Q9UIJ7 227 aa6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 B4DEV8 164 aa6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ERVK-16P61578 105 aa6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 RAB35Q15286 201 aa6.78□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.78□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.78□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.78□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.78□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 TEX30Q5JUR7 227 aa6.77□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CST9LP1Q5W188 147 aa6.77□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PIP4P1Q86T03 277 aa6.77□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.77□□□□□ -1.32
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USP54-210ENST00000466048 DECR2Q9NUI1 292 aa6.77□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.77□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.77□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 C7orf66A4D0T2 115 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 NPIPB7O75200 414 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF626Q68DY1 528 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 SPINK14Q6IE38 97 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 TEX29Q8N6K0 151 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 ARV1Q9H2C2 271 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 EPXP11678 715 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 CLDN12P56749 244 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP54-210ENST00000466048 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 OR10D3Q8NH80 312 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 WNT2BQ93097 391 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 PELI1Q96FA3 418 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 GNRHR2Q96P88 292 aa6.77□□□□□ -1.33
USP54-210ENST00000466048 GCM1Q9NP62 436 aa6.77□□□□□ -1.33
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