RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RTL6Q6ICC9 239 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF767PQ75MW2 155 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 LYG2Q86SG7 212 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 WDR86Q86TI4 376 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MDP1Q86V88 176 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC36Q8IYA8 594 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 WDR31Q8NA23 367 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR5AP2Q8NGF4 316 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR5M8Q8NGP6 311 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR4K15Q8NH41 348 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC107Q8WV48 283 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 BORCS8Q96FH0 119 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 IFT22Q9H7X7 185 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF69Q9UC07 566 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 AK3Q9UIJ7 227 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF222Q9UK12 451 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 HSPB11Q9Y547 144 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SVILO95425 2214 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PLCE1Q9P212 2302 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 BSNQ9UPA5 3926 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2QL1A1L167 161 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR5H14A6NHG9 310 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 AHRRA9YTQ3 701 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 K7EM74 188 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNHIT1O43257 154 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SMPD2O60906 423 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD6O75340 191 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TOXO94900 526 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SIX6O95475 246 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NAPSAO96009 420 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV3-15P01624 115 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PMP2P02689 132 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 RLN1P04808 185 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CRHP06850 196 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FCGR3AP08637 254 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CELA3BP08861 270 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM225BP0DP42 221 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CD79AP11912 226 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A4P12235 298 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CCL2P13500 99 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF35P13682 527 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FPR2P25090 351 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CALCRP30988 508 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PTGER4P35408 488 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 NPBWR2P48146 333 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FGF12P61328 243 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK11-1P61568 191 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FOXF2Q12947 444 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GRK1Q15835 563 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TAF9Q16594 264 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PIGYQ3MUY2 71 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 PLCXD3Q63HM9 321 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF880Q6PDB4 577 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM65Q6PI78 240 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS11Q6UWP2 260 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MOB3CQ70IA8 216 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CD163Q86VB7 1156 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 GAPTQ8N292 157 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OSR2Q8N2R0 312 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF611Q8N823 705 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms