RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 PMELP40967 661 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 P2RY1P47900 373 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 CFHR1Q03591 330 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 RHBDD1Q8TEB9 315 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 LYZL4Q96KX0 146 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 CHST5Q9GZS9 411 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 MAGT1Q9H0U3 335 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 PLEKHA2Q9HB19 425 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 LIPGQ9Y5X9 500 aa13.48□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1W2PQD3 144 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 TRGC2P03986 189 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 HEXBP07686 556 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 SFTPDP35247 375 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ERVFRD-1P60508 538 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 GAMTQ14353 236 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 MUCL1Q96DR8 90 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 LILRA5A6NI73 299 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 SOD3P08294 240 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC18Q8N456 261 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 OR1L3Q8NH93 324 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 HPSE2Q8WWQ2 592 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM234Q8WY98 164 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 C14orf144Q96I85 54 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 GINS3Q9BRX5 216 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA1EQ15878 2313 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 GPR137BO60478 399 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 QDPRP09417 244 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 NXPH1P58417 271 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 MYBPHQ13203 477 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 RSU1Q15404 277 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 FSCN3Q9NQT6 498 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa13.47□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 PIAS2O75928 621 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF728P0DKX0 622 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 FABP4P15090 132 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 DLK1P80370 383 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 UEVLDQ8IX04 471 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF610Q8N9Z0 462 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 OR14K1Q8NGZ2 314 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 MALSU1Q96EH3 234 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 CEP192Q8TEP8 1941 aa13.46□□□□□ -0.25
SFRP4-201ENST00000436072 OR5H15A6NDH6 313 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 LIPT2A6NK58 231 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DBHP09172 617 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GALNSP34059 522 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RND3P61587 244 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLC25A45Q8N413 288 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM217Q8N7C4 229 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 OR1N1Q8NGS0 311 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GPR173Q9NS66 373 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PIGLQ9Y2B2 252 aa13.46□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 VSTM2BA6NLU5 285 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BKO60814 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BJP06899 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BOP23527 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BBP33778 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CSNK1A1P48729 337 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BDP58876 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DCAF7P61962 342 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BCP62807 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM187Q14656 261 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST2H2BEQ16778 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DOK3Q7L591 496 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SSX9Q7RTT3 188 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BHQ93079 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DDIT4LQ96D03 193 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BNQ99877 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H2BMQ99879 126 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ARV1Q9H2C2 271 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SMOC1Q9H4F8 434 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PRDM13Q9H4Q3 707 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FAM86C1Q9NVL1 165 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ANXA10Q9UJ72 324 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF726A6NNF4 738 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RUNX1Q01196 453 aa13.45□□□□□ -0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZP4Q12836 540 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.2 ms