RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMCO3A2RU48 225 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAPPC13A5PLN9 417 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR5H14A6NHG9 310 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 F8WDY8 70 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 M0R3G1 203 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIRPB1O00241 398 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDUFAB1O14561 156 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 NCR3O14931 201 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARPC3O15145 178 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CASC3O15234 703 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHADO15335 359 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLCH2O75038 1416 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 B3GALNT1O75752 331 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLEKHA8P1O95397 391 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C1orf105O95561 183 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 LSM8O95777 96 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM50AO95807 157 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSPAN12O95859 305 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MBD3O95983 291 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TGFAP01135 160 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPX2P18283 190 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 BCKDHBP21953 392 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRTN3P24158 256 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 GGT2P36268 569 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRYBB2P43320 205 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAB7AP51149 207 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RND2P52198 227 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR4D2P58180 307 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 BST1Q10588 318 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 XRCC4Q13426 336 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 HTR4Q13639 388 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZCWPW2Q504Y3 356 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDZK1Q5T2W1 519 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 IDNKQ5T6J7 187 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEX36Q5VZQ5 186 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C16orf54Q6UWD8 224 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLEC18BQ6UXF7 455 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C2orf91Q6ZV80 131 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC35E3Q7Z769 313 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 DPPA2Q7Z7J5 298 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MARCH3Q86UD3 253 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 LHFPL1Q86WI0 220 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 HORMAD1Q86X24 394 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 DOLPP1Q86YN1 238 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC30A8Q8IWU4 369 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELMOD2Q8IZ81 293 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM123Q8N131 208 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZFP82Q8N141 532 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC35F6Q8N357 371 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 BBS5Q8N3I7 341 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR4F6Q8NGB9 312 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR11H6Q8NGC7 330 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR52E1Q8NGJ3 308 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR5B3Q8NH48 314 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBA3Q8TBC4 463 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CASTOR1Q8WTX7 329 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASZ1Q8WWH4 475 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ING5Q8WYH8 240 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT35Q92764 455 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MED12Q93074 2177 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMIGD2Q96BF3 282 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ECHDC3Q96DC8 303 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERP27Q96DN0 273 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMARCD1Q96GM5 515 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADTRPQ96IZ2 230 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TCEANC2Q96MN5 208 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSPAN32Q96QS1 320 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSKH2Q96QS6 385 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHP1Q99653 195 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANAPC13Q9BS18 74 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIM62Q9BVG3 475 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAPBPLQ9BX59 468 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PECRQ9BY49 303 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 REG4Q9BYZ8 158 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAF1Q9H063 256 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RIBC2Q9H4K1 309 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C6orf50Q9HD87 102 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 DCAF16Q9NXF7 216 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRO2289Q9P1D8 64 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR5V1Q9UGF6 321 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRO0628Q9UI54 55 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADAM28Q9UKQ2 775 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMCC3Q9ULS5 477 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 BTRCQ9Y297 605 aa-0.17□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms