RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 IP6K3Q96PC2 410 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR5H15A6NDH6 313 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FRG2CA6NGY1 282 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR5H1A6NKK0 313 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C9JQL5 133 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF6BO95407 300 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IL18BPO95998 194 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF883P0CG24 379 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH3B1P43353 468 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GATA4P43694 442 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZP4Q12836 540 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RSU1Q15404 277 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SHBQ15464 509 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2V2Q15819 145 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CR1LQ2VPA4 569 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TREML4Q6UXN2 200 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KMT5CQ86Y97 462 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LRTM2Q8N967 370 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR51F2Q8NH61 342 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ST7LQ8TDW4 575 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM234Q8WY98 164 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ISOC2Q96AB3 205 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TVP23CQ96ET8 276 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 YPEL4Q96NS1 127 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR10A2Q9H208 303 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NELFAQ9H3P2 528 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 EHFQ9NZC4 300 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1456Q9P272 454 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DKKL1Q9UK85 242 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf98E9PRG8 122 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 H3BSH0 61 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KCNAB3O43448 404 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CDC14BO60729 498 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 UTS2O95399 124 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LY86O95711 162 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GIMD1P0DJR0 217 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CTLA4P16410 223 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FGF7P21781 194 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LMO1P25800 156 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP1P28562 367 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFA6P56556 154 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2KP61086 200 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HSD11B2P80365 405 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 H3F3AP84243 136 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GNMTQ14749 295 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 COX15Q7KZN9 410 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GRINAQ7Z429 371 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IFI44Q8TCB0 444 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C14orf144Q96I85 54 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DECR2Q9NUI1 292 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FAM206AQ9NX38 181 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DOK5Q9P104 306 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KNL1Q8NG31 2342 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087X0M5 115 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GX30 115 aa6.28□□□□□ -1.4
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