RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 C15orf40Q8WUR7 153 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 PKIBQ9C010 78 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF16Q9NXF7 216 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 RAB22AQ9UL26 194 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 ARID1AO14497 2285 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0G2JMP0 313 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0X1KG70 313 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 ZP1P60852 638 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 PDZK1IP1Q13113 114 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A26Q70HW3 274 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 OR4M2Q8NGB6 313 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 OR11L1Q8NGX0 322 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 DLL4Q9NR61 685 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 ABCB10Q9NRK6 738 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM106BQ9NUM4 274 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0A6YYH2 397 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 A6NJ64 397 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 CTDSPLO15194 276 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 OR3A4PP47883 348 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 LYSMD2Q8IV50 215 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 NAV2Q8IVL1 2488 aa24.89■■□□□ 1.58
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM14DPA8MWL7 114 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 XRCC3O43542 346 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 RP2O75695 350 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 EFNB2P52799 333 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 IL24Q13007 206 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 Q8N402 240 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF525Q8N782 197 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC29Q8WV35 223 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 HPS1Q92902 700 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 DIABLOQ9NR28 239 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 RNF7Q9UBF6 113 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa24.89■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC30A6NM36 301 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 ANGPTL7O43827 346 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM225BP0DP42 221 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 VSIG8P0DPA2 414 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 IRF2P14316 349 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2G7Q13093 441 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 FAM189A2Q15884 450 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 CARTPTQ16568 116 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 STEAP3Q658P3 488 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 SNX29P2Q8IUI4 249 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 OR8H2Q8N162 312 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 OR51F2Q8NH61 342 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 KCNG3Q8TAE7 436 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD1Q96SE0 405 aa24.88■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 IFNL4K9M1U5 179 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 IL7P13232 177 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 CDK2P24941 298 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 BAK1Q16611 211 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM69Q5SWH9 247 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 MKXQ8IYA7 352 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 SLAMF9Q96A28 289 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 KCNK15Q9H427 330 aa24.87■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 AKR7A2O43488 359 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 SCGNO76038 276 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DQB1P01920 261 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 CSF3P09919 207 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 CFHR2P36980 270 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 C1QL2Q7Z5L3 287 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 GCSAMQ8N6F7 178 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 PHF21AQ96BD5 680 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF488Q96MN9 340 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 CHODLQ9H9P2 273 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 MTCH1Q9NZJ7 389 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM178BH3BS89 294 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 CYB5AP00167 134 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 UNC119Q13432 240 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 RGS21Q2M5E4 152 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 RAB12Q6IQ22 244 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 ASCL4Q6XD76 172 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 BATF2Q8N1L9 274 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 OR10Z1Q8NGY1 313 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 CST11Q9H112 138 aa24.86■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 METTL21EPA6NDL7 271 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 C3orf80F5H4A9 247 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 LHBP01229 141 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1D-12P01611 117 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 GMFBP60983 142 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf87Q8N0U7 546 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 S100A13Q99584 98 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 ATG5Q9H1Y0 275 aa24.85■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
ECHS1-201ENST00000368547 PGA5P0DJD9 388 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms