RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASF1BQ9NVP2 202 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF586Q9NXT0 402 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 INSIG2Q9Y5U4 225 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 V9GYY9 64 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MROH5Q6ZUA9 1318 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 NID2Q14112 1375 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TVP23AA6NH52 213 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C4orf51C9J302 202 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPK1AO00322 258 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC37A4O43826 429 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GMDSO60547 372 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEAD1P28347 426 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR4P46093 362 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRP11Q86VZ4 500 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 NELFCDQ8IXH7 590 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF555Q8NEP9 628 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBA3Q8TBC4 463 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOK4Q8TEW6 326 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MITD1Q8WV92 249 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RILPQ96NA2 401 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 THTPAQ9BU02 230 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRRQ9GZT4 340 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP21Q9H596 190 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKHQ9HCJ1 492 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDHAF3Q9NRP4 125 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM38BQ9NVV0 291 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAC3Q9UHF0 121 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1671Q9BY89 1806 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBED9Q6R2W3 1325 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 GMNCA6NCL1 334 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLL5B9A064 214 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 C15orf65H3BRN8 121 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFXANKO14593 260 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENTPD6O75354 484 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 RLN2P04090 185 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIPCP11150 499 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 GZMAP12544 262 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTNP21246 168 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTR2CP28335 458 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 P2RY2P41231 377 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC9A3R2Q15599 337 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF141Q15928 474 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSX1Q16384 188 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF404Q494X3 552 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PYDC2Q56P42 97 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTMPQ5BVD1 217 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDZD11Q5EBL8 140 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLLU1OSQ5K130 101 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP4Z1Q86W10 505 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM58AQ8N1B3 248 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR8A1Q8NGG7 326 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6N2Q8NGY6 317 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTL9Q8TC94 416 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 C22orf15Q8WYQ4 148 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADTRPQ96IZ2 230 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PKMYT1Q99640 499 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 BEX2Q9BXY8 128 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSGA10Q9BZW7 698 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCG5Q9H222 651 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB7Q9H672 318 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 VCX3AQ9NNX9 186 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 C12orf4Q9NQ89 552 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARP11Q9NR21 331 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA10Q9UJ72 324 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACOT9Q9Y305 439 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF27Q86VH2 1401 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC5A10A0PJK1 596 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 LEUTXA8MZ59 168 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 E7EWF7 191 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7EN84 100 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7ERS5 55 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPK2O00526 184 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSTAP01040 98 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTHLHP12272 177 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLNP12872 115 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL12BP29460 328 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEKP35659 375 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 CARD18P57730 90 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms