RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6V1FQ16864 119 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM27D1Q5T7N8 215 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPGNQ6UW88 154 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC18BQ6UXF7 455 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC19AQ6UXS0 136 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM231DQ6ZW35 169 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPRMLQ8N4K4 120 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00337Q8N6G1 96 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM184AQ8NB25 1140 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF555Q8NEP9 628 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4K2Q8NGD2 314 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR51A7Q8NH64 312 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 NT5CQ8TCD5 201 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 C20orf144Q9BQM9 153 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 THTPAQ9BU02 230 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMED9Q9BVK6 235 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 COA1Q9GZY4 146 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRLF2Q9HC73 371 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 LZTFL1Q9NQ48 299 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM38BQ9NVV0 291 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC7A11Q9UPY5 501 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ORC6Q9Y5N6 252 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYSFO75923 2080 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 VWA8A3KMH1 1905 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC100653049A0A140TA62 436 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BQ85 93 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENTPD6O75354 484 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT34O76011 436 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2A4O95047 310 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK1P06493 297 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTSGP08311 255 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF708P17019 499 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL31P62899 125 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELOCQ15369 112 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IDNKQ5T6J7 187 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUPD1Q68J44 220 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM144Q7Z5S9 345 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRNTQ86SH4 94 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR8A1Q8NGG7 326 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBA3Q8TBC4 463 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF14Q92956 283 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOP1MTQ969P6 601 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R36Q96LQ0 422 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2A7Q96R45 310 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSGA10Q9BZW7 698 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO44Q9H4M3 255 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFNKQ9P0W0 207 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAC3Q9UHF0 121 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 KPTNQ9Y664 436 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNA1GO43497 2377 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPV4 95 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0R1B8 84 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCAPO15273 167 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC37A4O43826 429 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALOX12BO75342 701 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-53P01767 116 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1-16P04430 117 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTHLHP12272 177 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 P2RY2P41231 377 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC18A1P54219 525 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF181Q2M3W8 571 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLLU1OSQ5K130 101 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf87Q6PH81 154 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASCL4Q6XD76 172 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 COMTD1Q86VU5 262 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CA13Q8N1Q1 262 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP18Q8N392 663 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNYL1Q8N7R7 359 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR51L1Q8NGJ5 315 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDNFQ8TB73 568 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM131CQ96AQ9 280 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM8Q96KF7 97 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF75AQ96N20 296 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RILPQ96NA2 401 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2M4Q96R27 311 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL26Q96S19 204 aa1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms