RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 OR2AK2Q8NG84 335 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 TERB2Q8NHR7 220 aa15.31■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 FAM172BPA6NC97 362 aa15.31■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 CRHP06850 196 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 PTGER4P35408 488 aa15.31■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 C17orf78Q8N4C9 275 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 PPA2Q9H2U2 334 aa15.29■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 OR5B21A6NL26 309 aa15.29■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 GIPP09681 153 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 RAC2P15153 192 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 AKR1C4P17516 323 aa15.29■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 FUT3P21217 361 aa15.29■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 FCGR3AP08637 254 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 LHFPL1Q86WI0 220 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 ZNF573Q86YE8 665 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 GPR132Q9UNW8 380 aa15.28■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.28■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.27■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 SLC22A5O76082 557 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 IGLV1-44P01699 117 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 GLI4P10075 376 aa15.27■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 LYG2Q86SG7 212 aa15.27■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM17Q86X19 198 aa15.27■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.27■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 SLC25A15Q9Y619 301 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 CEP295Q9C0D2 2601 aa15.27■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 C9orf170A2RU37 121 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 DTYMKP23919 212 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 DUSP1P28562 367 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 CALCRP30988 508 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 ARPC4P59998 168 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 RAP2BP61225 183 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 BAMBIQ13145 260 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.27■□□□□ 0.03
ACTB-201ENST00000331789 EDARQ9UNE0 448 aa15.27■□□□□ 0.03
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