RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAIR2Q6ISS4 152 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF144BQ7Z419 303 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS4Y2Q8TD47 263 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM89A2RUT3 159 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R1W7 72 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK5R1Q15078 307 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRIP3Q6Q6R5 217 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM185AQ8N0U4 392 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF14Q92956 283 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFT1Q96AA3 541 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL36RNQ9UBH0 155 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC2DQ9UHP7 191 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHDHQ9UQ10 334 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSCAML1Q8TD84 2053 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TK1P04183 234 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYL12AP19105 171 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL3P20749 454 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPBWR2P48146 333 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 COMPP49747 757 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL10A1Q03692 680 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC34A1Q06495 639 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLRD1Q13241 179 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC58Q4VC31 144 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 MKXQ8IYA7 352 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGHQ92820 318 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM80Q96HE8 168 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPACA5Q96QH8 159 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM234AQ9H0X4 552 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 VCXQ9H320 206 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0U1RQK1 487 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERICH4A6NGS2 130 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF737O75373 536 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 LALBAP00709 142 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1D-12P01611 117 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 OCM2P0CE71 109 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDZK1IP1Q13113 114 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8IYB0 196 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5D18Q8NGL1 313 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRG4Q8WWG1 115 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFAP2CQ92754 450 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A28Q96A46 364 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOX4Q9NPH5 578 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7N7A8 449 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT1B1O43704 296 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPTL7O43827 346 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 XPNPEP2O43895 674 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALX3O95076 343 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYB5AP00167 134 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRM2P08172 466 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 MELTFP08582 738 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL31P62899 125 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUCA2AQ02747 115 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST3GAL4Q11206 333 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf54Q6X4T0 127 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6YL49 198 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA12Q8IW75 414 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM58AQ8N1B3 248 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF485Q8NCK3 441 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4M1Q8NGD0 313 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52N1Q8NH53 320 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM82A0PJX8 343 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 OGG1O15527 345 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAND1O96004 215 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKACAP17612 351 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX2P48431 317 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLMHQ13867 455 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF273Q14593 569 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCR3LG1Q68D85 454 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms