RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM210A6NLX4 147 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 DISC1C4P0D8 188 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1D-12P01611 117 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 CD3DP04234 171 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNA6P05013 189 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.031e-8■■■□□ 14.6
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FUT3P21217 361 aa8.64□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 TAF9Q16594 264 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 TATDN3Q17R31 274 aa8.64□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 CALHM1Q8IU99 346 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 PECRQ9BY49 303 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51I2Q9H344 312 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 LRP5LA4QPB2 252 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 WIPF3A6NGB9 483 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 HMX3A6NHT5 357 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 CALCRP30988 508 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 MPV17P39210 176 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 RAB25P57735 213 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 LY6DQ14210 128 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTBL2Q562R1 376 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 Q8IYB0 196 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 PRAF2O60831 178 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 PEX14O75381 377 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 CD40P25942 277 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 CARTPTQ16568 116 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00596Q86U02 117 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4K15Q8NH41 348 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ST8SIA4Q92187 359 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 MED30Q96HR3 178 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRT1Q99946 306 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.62□□□□□ -1.03
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