RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM187Q14656 261 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SPINK14Q6IE38 97 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RNF122Q9H9V4 155 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 MEMO1Q9Y316 297 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TAAR5O14804 337 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 DEDDO75618 318 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 HOXB5P09067 269 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 UCP3P55916 312 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 Q6ZS49 121 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CALHM1Q8IU99 346 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SMIM8Q96KF7 97 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 STRADBQ9C0K7 418 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ACTL6AO96019 429 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 COX5BP10606 129 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ADCYAP1P18509 176 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 MICU1Q9BPX6 476 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A10PA6NDY2 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A18PA6NE21 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A7PA6NKC0 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A22PA8MWA6 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A12PA8MX19 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PDCD6O75340 191 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TMED6Q8WW62 240 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 DYRK2Q92630 601 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 MOB3AQ96BX8 217 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 NAA60Q9H7X0 242 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.9□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PQLC2LA1A4F0 135 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM218A2RU14 115 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 APOC3P02656 99 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 MPLP40238 635 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 LRRC46Q96FV0 321 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 C18orf12Q96KH6 178 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 GPR87Q9BY21 358 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 LPAR3Q9UBY5 353 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 SLC7A11Q9UPY5 501 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 ST3GAL6Q9Y274 331 aa11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 SIGLEC5O15389 551 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 FARS2O95363 451 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 PLATP00750 562 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 CELA3AP09093 270 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 OPRM1P35372 400 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 PIGPP57054 158 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 MMP26Q9NRE1 261 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 C21orf140B9A014 251 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 ATG12O94817 140 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 FAM219AQ8IW50 185 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 ACKR4Q9NPB9 350 aa11.89□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF724A8MTY0 619 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF728P0DKX0 622 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 STARD10Q9Y365 291 aa11.88□□□□□ -0.51
ATG4C-201ENST00000317868 MED13Q9UHV7 2174 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms