RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 BORCS8Q96FH0 119 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 C12orf49Q9H741 205 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 WFDC1Q9HC57 220 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 NBASA2RRP1 2371 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ARGFXA6NJG6 315 aa7.51□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 GPM6AP51674 278 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 GGNQ86UU5 652 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.51□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 RHOFQ9HBH0 211 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PCSK5Q92824 1860 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 TMEM127O75204 238 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 FOLR3P41439 243 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ZNF345Q14585 488 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 OPN5Q6U736 354 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZRG5 221 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 NEK7Q8TDX7 302 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 C5orf49A4QMS7 147 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 K7EPK0 472 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 HS3ST1O14792 307 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SYNGR3O43761 229 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 P04436 131 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 CD79AP11912 226 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 CPT2P23786 658 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 IL32P24001 234 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 GSK3AP49840 483 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ZNF84P51523 738 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.5□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 RNF138Q8WVD3 245 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 TMEM54Q969K7 222 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 C2orf50Q96LR7 162 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 Q96M66 194 aa7.5□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 FOXB1Q99853 325 aa7.5□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 SCTP09683 121 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SFTA3P0C7M3 94 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PRF1P14222 555 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PRKACAP17612 351 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 AADACP22760 399 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SPTSSAQ969W0 71 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 NTNG2Q96CW9 530 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 HSD17B6O14756 317 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 BCL3P20749 454 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 EPHA1P21709 976 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 CCL1P22362 96 aa7.5□□□□□ -1.21
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