RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 MFNGO00587 321 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SFTPBP07988 381 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SELEP16581 610 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 CPT2P23786 658 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 HLA-DMAP28067 261 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 RAG2P55895 527 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ACTBP60709 375 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ACTG1P63261 375 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 OR51F2Q8NH61 342 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 POLQO75417 2590 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 FBN2P35556 2912 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 HMX3A6NHT5 357 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SIAH2O43255 324 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SSX5O60225 188 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 GTF2F2P13984 249 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 HAAOP46952 286 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 GNG3P63215 75 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 HPS1Q92902 700 aa14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 A0A0B4J293 547 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 FCER2P06734 321 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 KITLGP21583 273 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 GIFP27352 417 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 NPBWR2P48146 333 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 CCR6P51684 374 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 MSMPQ1L6U9 139 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 WDR86Q86TI4 376 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 Q8NFD4 153 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 NRGNQ92686 78 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SLAMF9Q96A28 289 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 FZR1Q9UM11 496 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.84□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SYNGR1O43759 233 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 CRYAAP02489 173 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 GABRR1P24046 479 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 ARL6IP1Q15041 203 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 PIGYQ3MUY2 71 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 OSR2Q8N2R0 312 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 ST8SIA4Q92187 359 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 PECRQ9BY49 303 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 OR51I2Q9H344 312 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.83□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 H0YL77 283 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 CCNKO75909 580 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 TCRBP04435 133 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 CD3EP07766 207 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 BCL3P20749 454 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 FABP6P51161 128 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 RAB25P57735 213 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 TAF9Q16594 264 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF573Q86YE8 665 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 BATF2Q8N1L9 274 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 OR8G5Q8NG78 346 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 OR8S1Q8NH09 359 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 MICU1Q9BPX6 476 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 TACC2O95359 2948 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 CADP27708 2225 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 F8VVB4 439 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 F8VWA3 439 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 MLNRO43193 412 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 AKR7A2O43488 359 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 CD3DP04234 171 aa14.82□□□□□ -0.04
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