RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 LTBP1Q14766 1721 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 B4E171 279 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPAN7P41732 249 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10V1Q8NGI7 309 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 BCL2L11O43521 198 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CELA2AP08217 269 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 LIMS1P48059 325 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 MMP16P51512 607 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 DUSP18Q8NEJ0 188 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5AP2Q8NGF4 316 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ERGIC1Q969X5 290 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 SMIM10Q96HG1 83 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 MED9Q9NWA0 146 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5B21A6NL26 309 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 MT-ND4LP03901 98 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CD37P11049 281 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CSF2RBP32927 897 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 PLPPR5Q32ZL2 321 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CMTM2Q8TAZ6 248 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPAN2O60636 221 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTL6AO96019 429 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 DNASE2BQ8WZ79 361 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SCN2AQ99250 2005 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 NGFRP08138 427 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB25P24278 435 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB37Q5TC79 503 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX261Q6UWH6 196 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2M7Q8NG81 312 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 TAAR6Q96RI8 345 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 U3KQ87 197 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SOCS1O15524 211 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 CD300CQ08708 224 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SSX2Q16385 188 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAM5Q6NVV9 412 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 AP1S3Q96PC3 154 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 PRRX2Q99811 253 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 M0R1X1 148 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 CST2P09228 141 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 MGST1P10620 155 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 CEACAM6P40199 344 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 MOB1BQ7L9L4 216 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF75AQ96N20 296 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNE5Q9UJ90 142 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 MPC1Q9Y5U8 109 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 YIF1AO95070 293 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR13Q9H1Z4 485 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 NUDT19A8MXV4 375 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR37O15354 613 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 AVPI1Q5T686 147 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 HIF1ANQ9NWT6 349 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 QPCTLQ9NXS2 382 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0J9YW62 118 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 DXOO77932 396 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ERHP84090 104 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SAP25Q8TEE9 199 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR35Q9HC97 309 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 C9orf170A2RU37 121 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SFT2D2O95562 160 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM108Q6UXF1 575 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 CALCRP30988 508 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1456Q9P272 454 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SULT1A3P0DMM9 295 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SULT1A4P0DMN0 295 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 C15orf54Q8N8G6 183 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF485Q8NCK3 441 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 C14orf79Q96F83 325 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 DNPH1O43598 174 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFB3O43676 98 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB13P51153 203 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10Z1Q8NGY1 313 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC29Q8WV35 223 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 TMED3Q9Y3Q3 217 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 UMAD1C9J7I0 102 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-208ENST00000615445 SPICQ8N5J4 248 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms