RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM95Q3KNT9 176 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF573Q86YE8 665 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CALHM1Q8IU99 346 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MALSU1Q96EH3 234 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MROQ9BYG7 248 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR173Q9NS66 373 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 COPS3Q9UNS2 423 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PQLC2LA1A4F0 135 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 DHRS3O75911 302 aa20.64■□□□□ 0.89
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CAPNS1-211ENST00000590874 TTRP02766 147 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 RAP2AP10114 183 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 OSMP13725 252 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ROM1Q03395 351 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF626Q68DY1 528 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CHID1Q9BWS9 393 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 NOTCH3Q9UM47 2321 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC182A6NF36 153 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 B2RBV5 119 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX14O75381 377 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 BLCAPP62952 87 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM42Q69YG0 159 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 OR11H6Q8NGC7 330 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13D1Q8NGV5 346 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PITPNC1Q9UKF7 332 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 K7N7A8 449 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLL1P15814 213 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 MPZP25189 248 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ASRGL1Q7L266 308 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PRX2 142 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF254O75437 659 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF728P0DKX0 622 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1-8P0DP01 117 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK11-1P61568 191 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 COL10A1Q03692 680 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF23Q7RTU1 214 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A13Q9Y226 551 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ERICH4A6NGS2 130 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 A6NIN4 97 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 DLGAP1O14490 977 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 MPIG6BO95866 241 aa20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-211ENST00000590874 DYNLT3P51808 116 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 MNAT1P51948 309 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 RIDAP52758 137 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 EDDM3BP56851 147 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 WFDC9Q8NEX5 89 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 V9GYS6 101 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 F2RL2O00254 374 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF737O75373 536 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKACGP22612 351 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ESRRGP62508 458 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 OCSTAMPQ9BR26 566 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF556Q9HAH1 456 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GTI1 187 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 GNGT2O14610 69 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 OR12D2P58182 307 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 CD83Q01151 205 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB9Q96DX5 294 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 LRGUKQ96M69 825 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-211ENST00000590874 F8VVB4 439 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 F8VWA3 439 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EIL1 84 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTA2P62736 377 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTG2P63267 376 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTC1P68032 377 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTA1P68133 377 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 IL24Q13007 206 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAPC1Q16533 368 aa20.57■□□□□ 0.88
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