RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 MAB21L1Q13394 359 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ASAH1Q13510 395 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PLAC9Q5JTB6 97 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ELP2Q6IA86 826 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 OSR2Q8N2R0 312 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SPERTQ8NA61 448 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SCCPDHQ8NBX0 429 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 C19orf18Q8NEA5 215 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CXXC4Q9H2H0 198 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP23Q9Y6H3 246 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 F5H5P2 479 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 F8VVB4 439 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 F8VWA3 439 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 BCL3P20749 454 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 DEFA1P59665 94 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 DEFA3P59666 94 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 OXA1LQ15070 435 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ADIPOQQ15848 244 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FCAMRQ8WWV6 532 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ORC5O43913 435 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 RHBDL1O75783 438 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 HACD4Q5VWC8 232 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXL14Q8N1E6 418 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CHST4Q8NCG5 386 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TAAR3PQ9P1P4 343 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 KLK11Q9UBX7 282 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ROS1P08922 2347 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM235A6NFC5 223 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CYB5AP00167 134 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MELTFP08582 738 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PRSS3P35030 304 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GDNFP39905 211 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GUCA2AQ02747 115 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PIGYQ3MUY2 71 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CDNFQ49AH0 187 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 BEX5Q5H9J7 111 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 Q6ZTK2 550 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB3CQ96E17 227 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CYYR1Q96J86 154 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TLNRD1Q9H1K6 362 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNK7Q9Y2U2 307 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 AKR7A2O43488 359 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CD3EP07766 207 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GNB3P16520 340 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SELENOVP59797 346 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 DCDC5Q6ZRR9 648 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 BATF2Q8N1L9 274 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GPX8Q8TED1 209 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SEH1LQ96EE3 360 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 HS3ST6Q96QI5 342 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 POU2F3Q9UKI9 436 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MYO18BQ8IUG5 2567 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAPPC2LH3BP13 241 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 OR4A8P0C604 315 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SRP9P49458 86 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 RBM11P57052 281 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SIGIRRQ6IA17 410 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 C11orf53Q8IXP5 236 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 CENPSQ8N2Z9 138 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ST3GAL6Q9Y274 331 aa22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PLSCR5A0PG75 271 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 DEFB108AA8MXU0 73 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 H7C417 338 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MFNGO00587 321 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PTTG1O95997 202 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GRPP07492 148 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 GABRR1P24046 479 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 LOXP28300 417 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 INPP1P49441 399 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 FGF12P61328 243 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TAF9Q16594 264 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 NHLRC3Q5JS37 347 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 OR2Z1Q8NG97 314 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF488Q96MN9 340 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 SCPEP1Q9HB40 452 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF581Q9P0T4 197 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 MTFP1Q9UDX5 166 aa22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4-210ENST00000588555 E7EQL1 145 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SULT1C2O00338 296 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CDIPTO14735 213 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CD200P41217 278 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NEUROG1Q92886 237 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 POM121Q96HA1 1249 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
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