RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 OGG1O15527 345 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 SGCEO43556 437 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 PLPP2O43688 288 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 AIREO43918 545 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 CLPXO76031 633 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ADRA2AP08913 450 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 CTXN2P0C2S0 81 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 LINC00614P0C842 121 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 CD79AP11912 226 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 B4GALT1P15291 398 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 EDNRAP25101 427 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 PTAFRP25105 342 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 PSMB6P28072 239 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 GABRA5P31644 462 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 PSMB10P40306 273 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 OPRL1P41146 370 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ALDH3B1P43353 468 aa3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 ACTBP60709 375 aa3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ACTG1P63261 375 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 TRIM16LQ309B1 348 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 OTPQ5XKR4 325 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 RTL6Q6ICC9 239 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ARL9Q6T311 187 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 SSX6Q7RTT6 188 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 LUZP2Q86TE4 346 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 SKA3Q8IX90 412 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 OR52H1Q8NGJ2 320 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 THRSPQ92748 146 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 GHSRQ92847 366 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM203Q969S6 136 aa3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 YIPF6Q96EC8 236 aa3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 PELI1Q96FA3 418 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 AMELYQ99218 206 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ATF6BQ99941 703 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 TMED9Q9BVK6 235 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 PIGMQ9H3S5 423 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 STUB1Q9UNE7 303 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 COPS3Q9UNS2 423 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 RNF24Q9Y225 148 aa3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.55□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 FRYQ5TBA9 3013 aa3.54□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 A0A1B0GUH1 482 aa3.54□□□□□ -1.84
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FOXN3-210ENST00000555658 LINC00862A6NCI5 91 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 OR6C6A6NF89 314 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 LEUTXA8MZ59 168 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 F5H5K5 113 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 H3BMQ9 156 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 CCL21O00585 134 aa3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
FOXN3-210ENST00000555658 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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